MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.05

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020056	A	7	7	33	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020056	T	6	6	90	95	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020056	TATT	2	8	104	111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020056	GCC	2	6	193	198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020056	GGC	2	6	226	231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020056	TAA	2	6	276	281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020056	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020056	TAA	2	6	314	319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020056	AC	3	6	331	336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020056	TC	3	6	4543	4548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020056	GTT	2	6	4591	4596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020056	GT	3	6	4599	4604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020056	T	6	6	4624	4629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020056	GTC	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020056	CTTG	2	8	4764	4771	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020056	TAT	2	6	4778	4783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020056	ACT	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020056	AAAC	2	8	4897	4904	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020056	AGAA	2	8	5228	5235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020056	ATTT	2	8	5265	5272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020056	AAC	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020056	TA	3	6	5319	5324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020056	A	6	6	5342	5347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020056	T	6	6	5400	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020056	ATGCC	2	10	6306	6315	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_020056	TAT	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020056	AGAA	2	8	7415	7422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020056	ATT	2	6	7454	7459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020056	T	6	6	7458	7463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020056	TAA	2	6	7482	7487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020056	ATT	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020056	TCA	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020056	AT	4	8	7567	7574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020056	TG	3	6	7581	7586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020056	GTT	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020056	TCT	2	6	7608	7613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020056	ACA	2	6	7632	7637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020056	CT	3	6	7640	7645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020056	AAT	2	6	7650	7655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020056	AGT	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020056	CTT	2	6	7801	7806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020056	CAG	2	6	7822	7827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020056	GTA	2	6	7908	7913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020056	TGC	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020056	TA	4	8	8089	8096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020056	ATT	2	6	8114	8119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020056	TGA	2	6	8145	8150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020056	T	8	8	8579	8586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020056	AAG	2	6	9314	9319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020056	TAG	2	6	9378	9383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020056	TAC	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020056	TAG	2	6	9421	9426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020056	AGC	2	6	9464	9469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020056	CTT	2	6	9690	9695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020056	GA	3	6	9710	9715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020056	AT	3	6	9718	9723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020056	GGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020056	AGA	2	6	9779	9784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020056	GAAG	2	8	10798	10805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020056	TATC	2	8	10908	10915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020056	T	6	6	10932	10937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020056	TTTATA	2	12	11313	11324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020056	TGT	2	6	16731	16736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020056	TAT	2	6	20171	20176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020056	AAT	2	6	20204	20209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020056	CAA	2	6	20300	20305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020056	CA	3	6	20610	20615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.